螺桿式制冷壓縮機的自動啟停與活塞式制冷壓縮機啟停程序基本相似，這里要特別強調一點就是，在自動控制電路設計時.要保證機器停車，能量調節裝置處在最小能最上，以滿足制冷壓縮機輕載啟動的要求。
螺桿式制冷壓縮機的正常開機，停機信號常由智能液晶溫度控制器(或壓力控制器)，手動按鈕發出，非正常停車(即事故停車)由各安全保護裝置發出。
螺桿式制冷壓縮機在自動運行時，如果出現非正常情況，安置在壓縮機上的各種安全保護裝置馬上就會感知到并及時做出動作，切斷壓縮機電源使其停車.同時顯示出停車原因。在正常制冷運行中.通過能量調節機構.自動進行能量調節.保證制冷壓縮機的制冷最與制冷系統熱負荷相適應。
螺桿式制冷壓縮執早期的自動控制系統是采用繼電器控制電路，用帶可逆運轉電動機的凸輪開關(或稱凸輪調節儀)來實現可延時的能量逐級增減功能。但由于各控制元件性能不穩，常造成誤差，甚至誤動作，同時控制線路繁雜，維護修理都不方便，逐漸被可編程控制器所取代.但它的引人并沒有改變傳統的控制模式和系統組成.制作廠家在其基礎上不斷改進，隨著計算機科學技術的廣泛普及，至20世紀90年代后期出現了制冷裝置計算機智能化自動控制系統。這是一種充分發揮了計算機所具有的判斷，處理和運算功能，用于取代傳統控制，跳出了傳統控制模式。使制冷裝置智能化，最好的發揮裝置的能力和最大限度地提高其運行效率，使其成為真正的機電一體化裝置。
微電腦智能化控制型螺桿制冷機組自控設備.是采用微電腦控制器.用軟件程序完成機組全自動控制的電控設備，是實現全自動控制過程的理想設備，不僅能實現單臺機組的自動運行，還具有群控功能.通過多臺機組群控總線的連接，使多臺機組互相通訊協調工作，使整個機群以最佳狀態運行。具有兩種工作狀態，即手動控制狀態和自動運行狀態，有故障自動報警、自動保護的功能，并直接顯示出排氣壓力、吸氣壓力、噴油壓力和壓縮機電動機的運行電流。
