冷庫制冷系統的壓縮機是制冷系統中最主要的部件。壓縮機更換也是一件非常復雜的工作，如果更換沒處理好的話，會影響日后制冷效果。
冷庫制冷系統的壓縮機更換的操作步驟如下。
第一步：在真正確定壓縮機損壞后，損壞的壓縮機脫離管道搬走。在更換新壓縮機的時候必須對管道系統進行氮氣吹污處理，這樣可以有效防止雜物混進管道。處理完畢方可連接新的壓縮機系統。
第二步：在進行銅管焊接時為了不使銅管內壁生成氧化膜，必須通入氮氣保護管道。
第三步：禁止將壓縮機作為真空泵使用來排空外機管路中的空氣，這樣做即使沒有燒毀壓縮機也會對壓縮機產生很大的損害，嚴重時更可能會燒毀壓縮機，抽空必須使用真空泵來進行。
第四步：更換壓縮機后必須灌入壓縮機標準量的冷凍油。
第五步：更換壓縮機之后，干燥過濾器也要一同更換。因為干燥過濾器中的干燥劑已經飽和，失去了濾水功能。
第六步：更換完成后，就可以運行試機了。
在更換壓縮機冷凍油需要注意的問題是：在更換冷凍潤滑油之前要處理干凈制冷管道中殘留的冷凍油，因為不同牌號、批次的冷凍油不能混用，否則會造成冷凍潤滑油變質，造成潤滑效果不良，并導致壓縮機出現拉缸故障或出現冷凍潤滑油燒焦等一系列問題。
