(一)清掃與消毒
在果蔬的常年儲藏周轉過程中，在儲藏庫內墻壁、貨架、箱筐及空氣中存有較多的病原孢子。通常以細菌、青霉、曲霉、根霉及鏈格孢孢子居多，這些真菌和細菌是果蔬儲藏過程中發生侵染病害的主要病原，因此儲藏前和儲藏后對庫體及儲藏用具進行清洗和消毒十分重要。清洗消毒方法較多，可采取熏蒸、噴灑或物理方法。
(二)出庫及銷售前的處理
根據市場需求和果蔬儲藏的質量變化情況，決定要出庫時應當有計劃安排出庫日期并通知操作人員，以便做好出庫前的準備工作：氣調狀態的去除、清洗和打蠟、分級、包裝等處理工序。
(三)氣調庫的安全管理
氣調庫的安全管理是一項十分重要的工作，由氣調庫的特殊性決定。任何忽視安全管理的認識和做法都有可能造成不良后果和事故。因此，要求氣調庫的操作和管理人員一定要掌握氣調庫的安全管理知識，熟練掌握呼吸裝置的使用方法和氣調裝置的操作工藝流程。
