(1)預凍速率。預凍速率對物料的品質有一定的影響。快速冷凍對生物細胞影響較小，緩慢冷凍對生物細胞影響較大；快速冷凍形成的冰晶較小，對升華不利，但干燥后溶解快，慢速冷凍形成的冰品較大，對升華有利，但干燥后溶解慢；所以要尋找一個最佳預凍速率，以得到較高的存活率和較好的物理性狀以及較快的溶解速度，并對干燥過程中的升華有利。
(2)預凍的最低溫度。它一般根據物料的共熔點來決定，即預凍溫度應低于共熔點溫度5-10℃，而共熔點溫度的測定方法較多，如電阻檢測法、差熱分析儀掃描法、低溫顯微鏡直接觀察法、數學公式理論推算法等。由于電阻檢測法方便可行，日前應用較多。
(3)預凍時間。凍干機不同，總裝量不同，物料與隔板之間接觸不同，預凍的時間也不同，預凍時間一般由實驗來確定，但必須保證在抽真空之前物料的所有部分都被凍實。
