冷藏集裝箱可廣泛應用于鐵路、公路、水路和空中運輸，是一種經濟合理的運輸方式。使用冷藏集裝箱運輸的優點如下：
(1)裝卸效率高，人工費用低:采用冷藏集裝箱，簡化了裝卸作業，縮短了裝卸時間，提高了裝卸負荷，降低了運輸成本。
(2)調度靈便，周轉速度快，運輸能力大，對小批量冷貨也適合，
(3)大大減少甚至避免了運輸貨損和貨差。冷藏集裝箱運輸在更換運輸工具時，不需要重新裝卸食品，簡化了理貨手續，為消滅貨損、貨差創造了十分有利的條件。
(4)提高貨物質量:箱體內溫度可以在一定的范圍內調節，箱體上還設有換氣孔，因此能適應各種易腐食品的冷藏運輸要求，保證易腐食品的冷藏鏈不中斷，而且溫差可控制在±1℃之內，避免了溫度波動對產品質量的影響，實現從“門到門”的運輸。
