為保護消費者權益，加強食品企業的監管，有效應對國際農產品貿易壁壘，農業部制定了《農產品質量安全追溯操作規程通則》《農產品追溯編碼導則》等行業標準。
畜肉方面，2002年，農業部頒布《動物免疫標識管理辦法》，建立豬、牛、羊等動物免疫檔案管理制度，佩帶免疫目標。2003年，中國物品編碼中心建立了牛肉產品跟蹤與追溯系統，取代了人工的耳標標識，并先后編制了《牛肉制品追溯指南》《牛肉質量跟蹤與溯源系統實用方案》應用指南。
果蔬方面，2004年，北京市農業局和河北省農業廳共同建立了以標簽管理為中心的市場準人管理辦法：北京市農業局與北京綠富隆農業股份有限公司合作，建立了北京市農業局食用農產品質量安全追溯系統：國家條碼推進工程辦公室在山東省濰坊市壽光田苑蔬菜基地和洛城蔬菜基地建立了無公害蔬菜質量安全追溯系統。
水產品方面，國家總局質量監督檢驗檢疫總局發布了《出境水產品追溯規程（試行）》和《出境養殖水產品檢驗檢疫和監管要求（試行）》，甘肅省蘭州市建立了水產品質量安全的可追溯系統。
不難看出，我國針對農產品質量追溯的規范、通則制定速度越來越快。但是基本上都是針對特定農產品、特定區域的相應追溯體系，還沒有形成國家級的食品安全追潮溯平臺和通用型的追溯體系。
