（一）冷鏈運輸裝備管理
冷鏈運輸裝備主要包括鐵路、公路、航空及水路冷鏈運輸工具。其中要管理的元素有運輸能力（包括裝載體積、重量）、運輸速度、能源消耗計量等。運輸業務包括外包服務，因此冷鏈運輸資源還需包括冷鏈運輸服務提供商的管理。
（二）冷鏈運輸線路管理
冷鏈運輸線路管理的主要目的是建立冷鏈運輸服務區域數據庫。其主要可分為區域型、線路型和混合型運輸線路管理。運輸線路的通暢是進行優化的基礎，需要考慮站點之間的路徑流量、高峰時間流量、站點之間發生事故的頻率以及運輸工具等因素。
（三）操作人員管理
由于易腐貨物的在途運輸會遇到許多意外情況，因此要綜合考慮駕駛員的技能、操作經驗值與人力資源成本之間的關系，合理定崗。
（四）客戶管理
冷鏈運輸管理的需求主要來自物流公司的運輸需要、廠家送貨需求以及客戶提貨需求。冷鏈物流公司主要是指第三方物流公司，包括貨代企業。因此，冷鏈運輸管理系統主要針對不同的用戶需求分別提供不同的運輸服務。
（五）冷鏈運輸訂單管理
冷鏈運輸管理系統根據用戶的不同需求產生不同的運輸訂單，提供合理、成本最低的運輸方案。根據運輸訂單運行運輸的組合作業，可以提高運輸效率。由此制訂的運輸計劃安排的結果要最大限度地保證時效性、經濟性及安全性。
（六）冷鏈運輸成本核算
冷鏈運輸管理主要關注可變成本中的能源消耗的影響因素，如路徑長度、道路通暢能力、駕駛員操作技術以及氣候原因等因素。
（七）作業跟蹤
在實際的冷鏈運輸作業中，作業跟蹤主要是通過運輸訂單的回單收集手機短信、GPS，實現合理安排運輸計劃、減少空車營運、提高異常事件的處理應對能力。
