箱內貨物的堆裝一定要防止氣流組織形成“短路”或“斷路”，如圖512所示為幾種不正確的冷藏集裝箱貨物堆裝方式。在圖5-12a中，由于貨物裝載太分散，貨物之間的空間無任何流動阻力，從底部T形風軌送入的冷風將通過貨物之間的空間直接回流到制冷裝置，而造成氣流的“短路”。在圖5-12b中，貨物僅裝載在冷藏箱的后部，在前部留下了無遮蓋的空間，從T形風軌送人的冷風將直接返回到制冷裝置，造成嚴重的氣流“短路”，氣流組織將不會對貨物產生任何直接的影響。在圖5-12?中，貨物僅裝載在冷藏箱的前部，在后部留下了無遮蓋的空間，由于空氣總是向流動阻力最小處流動，因此從T形風軌送入的冷風將繞過貨物裝載區，從冷藏箱后部通過上部回風通道返回到制冷裝置，造成氣流的“短
路”。在圖5-12d中，由于不正確地在貨物上部覆蓋了不透風的塑料薄膜等覆蓋物，使氣流“斷路”而無法通過上部回風通道回到制冷裝置。在圖5-12中，貨物裝載高度超過最高貨物裝載線，沒有在貨物上部與冷藏箱頂部之間留下必要的回風通道，從而造成氣流的“斷路”，影響制冷效果。
冷藏集裝箱在貨物裝箱前不必進行預冷，除非從有密封門的冷庫中裝貨時才有必要進行預冷。否則不但造成不必要的能量浪費，而且在貨物裝載過程中，大量外界熱濕空氣進入冷藏箱內，產生凝水，對貨物造成損害。
